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2021
年
第
9
期
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Review
体外疗法在重症COVID-19患者中的应用
Zhifeng ZHOU,Huang KUANG,Yuexian MA,Ling ZHANG
2021, 22(9): 701-717. DOI: 10.1631/jzus.B2100344
摘要:新型冠状病毒型肺炎(COVID-19)大流行是由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的重大公共卫生事件。COVID-19已在世界各地广泛传播。很大比例的患者因呼吸衰竭和多器官功能障碍而发展为重症或危重症,并且死亡率很高。因此,为危重患者提供及时有效的治疗对于降低总体死亡率至关重要。恢复期血浆治疗,干扰素-α(IFN-α)、皮质类固醇和托珠单抗的气雾吸入等药物治疗均已应用于临床治疗,但其效果仍存在争议。最近的研究表明,体外疗法可能在治疗COVID-19危重患者方面发挥潜在作用。在这篇综述中,我们阐述了连续性肾脏替代疗法(CRRT)、治疗性血浆置换(TPE)、血液吸附(HA)、体外膜肺氧合(ECMO)和体外二氧化碳清除(ECCO
2
R)在重症COVID-19患者中的应用,为COVID-19的进一步诊断和治疗提供支持。
关键词:新型冠状病毒型肺炎(COVID-19);重症疾病;细胞因子释放综合征(CRS);急性肾损伤(AKI);体外疗法
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发布时间:2021-11-17
Research Article
心力衰竭相关脑卒中的潜在生物学过程和关键靶点的生物学分析
Chiyu LIU,Sixu CHEN,Haifeng ZHANG,Yangxin CHEN,Qingyuan GAO,Zhiteng CHEN,Zhaoyu LIU,Jingfeng WANG
2021, 22(9): 718-732. DOI: 10.1631/jzus.B2000544
摘要:目的本研究通过加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)揭示心力衰竭(心衰)相关脑卒中的发病机制,为临床防治心衰相关脑卒中提供关键靶点。创新点本研究基于网络的研究策略,首次揭示了心衰相关脑卒中的潜在分子相互作用机制以及可能参与的生物学过程,并筛选出其中的关键基因。方法我们从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus database,GEO)中分别获得心衰和脑卒中相关的芯片数据,并通过WGCNA鉴定各自的关键模块与关键基因。然后我们将二者的关键模块与关键基因取交集后,得到心衰相关脑卒中的关键基因,并利用Reactome和Cytoscape数据库对关键基因进行功能注释。最后在多个数据集中对心衰相关脑卒中的关键基因进行验证。结果我们在心衰和脑卒中相关芯片数据中分别鉴定出两个关键模块,随后功能富集分析发现两种疾病的关键模块中的基因均参与了蛋白质泛素化,Wnt信号通路和外泌体三个生物学过程。取交集后,我们共得到155个共同基因,他们可能参与了心衰相关脑卒中的发病机制。其中,OTULIN和NFIL3被识别为心衰相关脑卒中的关键基因。功能注释分析显示,OTULIN参与了蛋白质泛素化和Wnt信号通路,NFIL3参与了转录和翻译过程。最后,在多个心衰和脑卒中的芯片数据中均证实OTULIN和NFIL3表达显著上调。结论蛋白质泛素化,Wnt信号通路和外泌体等生物学过程在心衰相关脑卒中的发病机制中发挥了重要作用。OTULIN和NFIL3通过调节这些通路因而可作为心衰相关脑卒中潜在的干预靶点。
关键词:心力衰竭;心源性卒中;生物信息学分析;加权基因共表达网络分析(WGCNA)
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发布时间:2021-11-17
通过非靶向代谢组学和转录组学发现人动脉粥样硬化性腹主动脉瘤的潜在生物标志物
Lei JI,Siliang CHEN,Guangchao GU,Wei WANG,Jinrui REN,Fang XU,Fangda LI,Jianqiang WU,Dan YANG,Yuehong ZHENG
2021, 22(9): 733-745. DOI: 10.1631/jzus.B2000713
摘要:目的腹主动脉瘤(AAA)和动脉粥样硬化(AS)在临床危险因素和分子发病机制上有相当大的相似之处。我们的研究旨在从代谢组学的角度研究AAA和AS之间的差异,并通过与转录组学的整合分析探索差异代谢物的潜在机制。创新点从代谢组学的角度探究了AAA和AS之间的差异;采用关联分析,探究差异代谢物和差异基因的交互作用整合了代谢组学和转录组学。方法应用32例AAA和32例AS患者的血浆样本表征代谢物谱,采用非靶向液相色谱质谱法(LC-MS),探究AAA与AS之间代谢物水平的差异;应用GEO数据集GSE57691,探究AAA与AS之间基因表达的差异;最后应用Spearman相关分析探究差异代谢物与差异基因之间的相关性。结论本研究共鉴定出18种显著差异代谢物,其中7种代谢物的组合可能作为区分AAA和AS的生物标志物,曲线下面积(AUC)为0.93。通过整合代谢组学和转录组学数据,发现这7种代谢物,尤其是2’-脱氧-D-核糖(2dDR)与差异表达基因显著相关。本研究提供了AAA和AS患者血浆代谢物的全面概况,并为动脉粥样硬化性AAA的发病机制提供了研究方向。
关键词:腹主动脉瘤(AAA);动脉粥样硬化(AS);非靶向代谢组学;转录组学
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发布时间:2021-11-17
内质网应激参与反复瞬时高眼压诱导的视网膜损伤
Xue YANG,Xiaowei YU,Zhenni ZHAO,Yuqing HE,Jiamin ZHANG,Xiaoqian SU,Nannan SUN,Zhigang FAN
2021, 22(9): 746-756. DOI: 10.1631/jzus.B2100053
摘要:目的研究和探讨反复瞬时高眼压对视网膜的损伤作用及其潜在的分子机制。创新点模拟临床上青光眼患者夜间难以检测到的眼压峰值波动对视网膜的影响,首次证明反复的瞬时高眼压对视网膜具有直接损伤效应,其损伤机制与内质网应激通路激活有关。方法通过眼前房生理盐水灌注,建立小鼠反复瞬时高眼压模型(50mmHg,1min×7次),连续灌注处理1、3和7天后,采用视网膜铺片(Whole-mount retina)评估视网膜神经节细胞(RGC)损伤情况;用TUNEL法检测视网膜全层细胞凋亡;用转录组测序(RNA-seq)筛选参与视网膜损伤的分子通路;用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)进一步检测内质网应激通路相关分子的表达。结论反复瞬时高眼压可以损伤视网膜全层,并呈时间依赖性的由外核层细胞(ONL)死亡进展至视网膜神经节细胞层(GCL)死亡。内质网应激相关信号通路中肌醇酶1(IRE1)信号通路激活参与了视网膜的损伤过程。
关键词:内质网应激;瞬时眼压峰值(Spike IOP);视网膜损伤;视网膜神经细胞凋亡;青光眼
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发布时间:2021-11-17
已报道的全基因组选择性消除分析中发现
IGF2BP2
基因的插入/缺失变异与山羊产羔数相关
Dongyun XIN,Yangyang BAI,Yi BI,Libang HE,Yuxin KANG,Chuanying PAN,Haijing ZHU,Hong CHEN,Lei QU,Xianyong LAN
2021, 22(9): 757-766. DOI: 10.1631/jzus.B2100079
摘要:目的验证IGF2BP2插入/缺失与陕北白绒山羊产羔数之间的关系,并选择有利的等位基因。创新点首次筛选、验证山羊IGF2BP2基因的InDel位点,确定其与山羊产羔性状的相关性及作用,为山羊经济性状改良及新品种培育提供理论依据。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)方法分析IGF2BP2在单羔组和多羔组中的表达水平;通过PCR扩增-琼脂糖凝胶电泳在918只陕北白绒母山羊中鉴定IGF2BP2基因P4-Ins-13bp和P5-Del-12bp缺失/插入位点基因型,并进行测序以验证突变;利用SHEsis平台分析两个位点的连锁不平衡;采用方差分析(ANOVA)和χ
2
检验分析山羊IGF2BP2基因变异与产羔数的关系;并利用在线数据库预测转录因子(TF)和突变区域序列的结合。结论本研究发现,IGF2BP2的mRNA表达水平在单羔组明显高于多羔组。在陕北白绒母山羊中验证了IGF2BP2基因内的插入/缺失(indels),包括P4-Ins-13bp和P5-Del-12bp。χ
2
检验表明,P4-Ins-13bp基因型(χ
2
=14.479,P=0.006)在单羔和多羔组间分布差异显著;相关分析表明,P4-Ins-13bp与山羊产仔数显着相关(P=0.022),具有缺失/缺失(DD)基因型的山羊个体产仔数高于其他山羊。因此,IGF2BP2基因的P4-Ins-13bp突变可作为一种潜在的与繁殖性状显著相关的分子标记,以优化母羊繁殖力,提高山羊产业的经济效益。
关键词:山羊;IGF2BP2;产仔数;插入/缺失;分子标记辅助选择
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发布时间:2021-11-17
Correspondence
S
-腺苷甲硫氨酸对淀粉酶产色链霉菌1628次级代谢产物产量的影响
Yefeng HU,Juan WANG,Jie XU,Zheng MA,Andreas BECHTHOLD,Xiaoping YU
2021, 22(9): 767-773. DOI: 10.1631/jzus.B2100115
关键词:淀粉酶产色链霉菌1628;S-腺苷甲硫氨酸;MetK;丰加霉素;四烯大环内酯类
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发布时间:2021-11-17
低剂量率脉冲放疗模式显著提高腹部盆腔恶性肿瘤的治疗效果
Xin WEN,Hui QIU,Zhiying SHAO,Guihong LIU,Nianli LIU,Aoxing CHEN,Xingying ZHANG,Xin DING,Longzhen ZHANG
2021, 22(9): 774-781. DOI: 10.1631/jzus.B2000793
关键词:低剂量率脉冲放射治疗;低剂量辐射超敏感性/辐射抗性增强;腹盆腔恶性肿瘤;亚致死损伤半修复时间
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发布时间:2021-11-17
MAPK、AKT和NF-κB信号通路在温和气单胞菌诱导宿主细胞炎性应答中的作用及分子机制研究
Wei ZHANG,Bello Babatunde KAZEEM,Haitao YANG,Gang LIU,Guanglu WANG,Zhixing LI,Tao GUO,Panpan ZHAO,Jingquan DONG
2021, 22(9): 782-790. DOI: 10.1631/jzus.B2100456
关键词:温和气单胞菌;免疫应答;丝裂原活化蛋白激酶(MAPK);蛋白激酶B(AKT);核因子κB(NF-κB)
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发布时间:2021-11-17
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